Western Blot實驗過程中常遇到的問題
Western 免疫印跡(Western Blot)是將蛋白質轉移到膜上,然后利用抗體進行檢測。對已知表達蛋白,可用相應抗體作為一抗進行檢測,對新基因的表達產(chǎn)物,可通過融合部分的抗體檢測。
WB 實驗中常會出現(xiàn)各種問題,迪申生物技術(上海)有限公司專注于生物試劑免疫組化相關產(chǎn)品多年,對 WB 實驗有一定了解,今天跟各位同學一起分享下 WB 實驗中各種問題及應用對策。
電泳條帶成笑臉狀 膠不均勻冷切,中間冷卻不好,電泳系統(tǒng)溫度偏高 減少電壓減慢電泳速度,在冷室或者冰浴中進行電泳
電泳條帶成皺眉狀 可能是由于裝置不合適,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不* 調整裝置
拖尾 樣品溶解不好 樣品充分溶解混勻后上樣
紋理(縱向條紋) 樣品中含有不溶性顆粒 樣品充分攪拌混勻
條帶偏斜 電極不平衡或者加樣位置偏斜 調整電極和加樣
條帶兩邊擴散 加樣量過多 適當減少上樣量
Marker 變黑色 抗體和 Marker 蛋白反應 在 Marker 和 sample 之間空出一個孔不上樣
背景高 膜封閉不夠 延長封閉時間,選擇適宜的抗體稀釋度
一抗稀釋度不適宜 對抗體進行滴度測試,選擇適宜的抗體稀釋度
一抗孵育的溫度偏高 建議 4℃ 結合過夜
二抗?jié)舛榷冗^高 降低二抗?jié)舛?/p>
二抗的非特異性背景 增加一個二抗對照,不加一抗,其他操作過程不變,即可驗證背景是否是由于二抗所致。可選擇其它二抗(特異性更強的,只針對重鏈)
二抗孵育時間過久 減少二抗孵育時間
選擇膜的問題 硝酸纖維素的背景會比 PVDF 膜低
膜在實驗過程中干過 實驗過程中要注意保持膜的濕潤
檢測時曝光時間過長 注意曝光時間的縮短
洗膜不充分 增加洗膜的時間和次數(shù)
抗體和封閉蛋白有交叉反應 檢測抗體與封閉蛋白的交叉反應性,選擇無交叉反應的封閉劑。洗滌液中加入 Tween-20 可減少交叉反應
雜帶較多 目的蛋白有多個修飾位點(化位點,糖基化位點,乙?;稽c等),本身可以呈現(xiàn)多條帶 查閱文獻或進行生物信息學分析,獲得蛋白序列的修飾位點信息,通過去修飾確定蛋白試劑大小
目的蛋白有其他剪切本 查閱文獻或生物信息學分析可能性
樣品處理過程中目的蛋白發(fā)生降解 裂解液中加入蛋白酶抑制劑,樣品處理在冰上進行
上樣量過高,太敏感 適當減少上樣量
一抗不純 純化抗體
一抗特異性不高 重新選擇或制備高特異性的抗體
二抗的非特異性結合 增加一個二抗對照,不加一抗,其他操作過程不變,即可驗證背景是否是由于二抗所致。可選擇其它二抗(特異性更強的,只針對重鏈)
一抗或二抗?jié)舛绕?降低抗體濃度
細胞傳代較多,導致蛋白變異 使用原代或傳代少的細胞作對照
蛋白條帶位置
(大?。┎粚?二聚體或多聚體存在 增加蛋白質變性過程及強度
翻譯后剪切 比如很多蛋白是以前體蛋白的形式合成的,在執(zhí)行功能時需要進行剪切成活化的形式
相對電荷 氨基酸電荷的組成
蛋白修飾 比如糖基化、化等修飾狀態(tài)會導致蛋白分子量增加
膠濃度 不同濃度的膠跑出的蛋白條帶的位置可能有所偏差
無蛋白條帶 抗體孵育不充分 增加抗體濃度,延長孵育時間
酶失活 直接將酶和底物進行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內、有活性的酶聯(lián)物
標本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低 設置陽性對照,如果陽性對照有結果,但標本沒有則可能是標本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低??煽紤]增加標本上樣量解決靶蛋白含量低的原因
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