PCR法支原體檢測試劑盒介紹的太全面了,歡迎圍觀!
儲存條件
該產(chǎn)品在常溫下運(yùn)輸,收到產(chǎn)品后,請立即放-20 ℃冰箱低溫保存。該條件下,至少2年內(nèi)有效。
產(chǎn)品用途
《PCR法支原體檢測試劑盒》可用于檢測一切可能含支原體的樣品,比如:(1)體外細(xì)胞培養(yǎng)的上清;(2)血清;(3)各種體液,如唾液、尿液、鼻腔分泌物等;(4)別的液體樣品。本產(chǎn)品僅供研究使用。
產(chǎn)品簡介
哺乳動物細(xì)胞的培養(yǎng),支原體(Mycoplasma)污染是個(gè)世界性的問題。支原體污染幾乎可以改變細(xì)胞的所有參數(shù),導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的不準(zhǔn)確、甚至*錯(cuò)誤。從2013年開始,《Nature》期刊已正式要求投稿的文章,如涉及細(xì)胞培養(yǎng)都要進(jìn)行支原體檢測。相信會有越來越多的高水平期刊將做出同樣的支原體檢測要求。
培養(yǎng)法是相對可靠的支原體檢測技術(shù),但是該方法非常耗時(shí)的,需要數(shù)周,不適合作為細(xì)胞培養(yǎng)液中支原體污染的快速檢測。此外,通過固體培養(yǎng)法無法檢測污染細(xì)胞的一種zui常見的支原體,即豬鼻支原體(M.Hyorhinis)。這是因?yàn)樨i鼻支原體無法在支原體固體培養(yǎng)基上形成可見的菌落。而豬鼻支原體約占所有支原體污染的20-50%。
有的實(shí)驗(yàn)室使用熒光染色法檢測支原體,但是該方法靈敏度太低,當(dāng)檢測成陽性時(shí),細(xì)胞經(jīng)常已經(jīng)嚴(yán)重污染。
目前,細(xì)胞培養(yǎng)液中支原體污染的檢測通常使用的是PCR法。但是PCR法也有明顯的缺點(diǎn):(1)整個(gè)過程大約需要3個(gè)小時(shí);(2)由于細(xì)胞培養(yǎng)數(shù)天后,培養(yǎng)液中經(jīng)常含有嚴(yán)重抑制PCR擴(kuò)增的代謝物,所以樣品的前處理一般是PCR法*的環(huán)節(jié);(3)PCR法的靈敏度有限,通常需要將培養(yǎng)液離心濃縮或者抽提DNA后再檢測;(4)PCR產(chǎn)物的電泳,需要用到EB等潛在的致癌物質(zhì);(5)需要用到PCR儀、電泳槽、凝膠成像儀、離心機(jī)等儀器。
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試劑盒組成
檢測過程:
待測樣品的準(zhǔn)備
為了準(zhǔn)確判斷細(xì)胞是否有支原體的污染,待測的細(xì)胞培養(yǎng)液樣品來源于至少培養(yǎng)3天且匯合度在70-90%左右的細(xì)胞培養(yǎng)液上清(貼壁細(xì)胞)。懸浮培養(yǎng)的細(xì)胞也需要在換液傳代后,至少讓細(xì)胞生長3天再取培養(yǎng)液進(jìn)行檢測。取150 μL上述待測樣品,在普通臺式離心機(jī)上1200 rpm (大約150-200 g)離心5 min,取離心后的上清100 μL用于支原體檢測,丟棄下層剩余的50 μL(含細(xì)胞沉淀)。收集并已經(jīng)離心去除細(xì)胞的待測樣品如果不立即檢測,請放于-20℃或-80℃冰箱保存,不得放于室溫或4℃冰箱。樣品在-20℃至少可以保存一個(gè)月,在-80℃基本可以保存。
注意:本步驟的低速離心是為了去除哺乳動物細(xì)胞,以排除其不必要的干擾。所以離心力要嚴(yán)格控制在150-200 g,該離心力下,哺乳動物細(xì)胞將被沉淀下來而支原體不會。如果錯(cuò)誤使用更高的離心力將可能導(dǎo)致支原體也被離心下來,從而導(dǎo)致假陰性。
PCR體系的配制
請按下表(表1)進(jìn)行PCR體系(總體積25 μL)的配制:
表1.PCR擴(kuò)增體系的配制
| Negative Control | Positive Control | Sample |
去離子水 | 17.5 μL | 15.5 μL | 15.5 μL |
10×Taq DNA 聚合酶緩沖液(含Mg2+) | 2.5 μL | 2.5 μL | 2.5 μL |
2.5 mM dNTP | 2.5 μL | 2.5 μL | 2.5 μL |
5 Units/μL Taq DNA 聚合酶 | 0.5 μL | 0.5 μL | 0.5 μL |
支原體引物和內(nèi)參 | 2 μL | 2 μL | 2 μL |
陽性支原體DNA或待測樣品 | - | 2 μL | 2 μL |
結(jié)果判斷
PCR擴(kuò)增的結(jié)果有可能出現(xiàn)以下幾種情況(表2):
表2. PCR擴(kuò)增的可能結(jié)果
| 電泳結(jié)果 | 電泳結(jié)果 | 電泳結(jié)果 | 電泳結(jié)果 | 電泳結(jié)果 | 電泳結(jié)果 |
586 bp內(nèi)參條帶 | ++ | - | + | ++ | ++ | - |
270 bp左右條帶 | - | ++++ | +++ | ++ | + | - |
結(jié)果圖示(見圖1) | 泳道1 | 泳道2 | 泳道3 | 泳道4 | 泳道5 | 泳道6 |
支原體污染判斷 | 陰性 | 極重度污染 | 重度污染 | 中度污染 | 輕度污染 | PCR被抑制 |
注:“-”代表沒有條帶;“+”代表有條帶;“+”號越多代表?xiàng)l帶越強(qiáng)。
圖1. 支原體PCR擴(kuò)增結(jié)果。586 bp條帶為內(nèi)參條帶,270 bp左右的條帶為支原體特異條帶(各支原體的條帶大小會略有不同,總體在260-280 bp)。隨著支原體DNA模板的增加,270 bp左右的條帶會逐漸增強(qiáng)而586 bp的內(nèi)參條帶會逐漸減弱,甚至消失。泳道1:陰性對照或者沒有支原體污染的樣品;泳道2:極重度支原體污染樣品;泳道3:重度污染樣品;泳道4:中度污染樣品;泳道5:輕度污染樣品;泳道6:PCR的擴(kuò)增被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制,導(dǎo)致擴(kuò)增失敗。M:DNA marker.
注意事項(xiàng)
每次檢測都應(yīng)該設(shè)有陰性對照,作用有:
(1)由于有效的PCR擴(kuò)增,陰性對照也會有一條586 bp的內(nèi)參條帶,這樣可以保證本試劑盒含有的支原體引物和內(nèi)參以及自己準(zhǔn)備的Taq DNA 聚合酶,dNTP等試劑沒有問題;
(2)只有當(dāng)陰性對照的結(jié)果沒有出現(xiàn)270 bp左右的支原體特異條帶時(shí),別的樣品的結(jié)果才是可信的。
如果586 bp條帶和270 bp左右的條帶都沒有出現(xiàn)(如圖1,泳道6),在排除PCR試劑的問題后(即陰性對照可以正常擴(kuò)增),說明該樣品含有抑制PCR擴(kuò)增的代謝產(chǎn)物。有關(guān)PCR的擴(kuò)增會被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制的問題,Sigma公司的LookOut Mycoplasma PCR Detection Kit(貨號MP0035)的PCR法支原體檢測試劑盒說明書中也特別提到了這點(diǎn),說明這是一個(gè)PCR法支原體檢測中經(jīng)常遇到的問題,其強(qiáng)烈建議用試劑盒進(jìn)行DNA提取后再進(jìn)行鑒定。這也是PCR法支原體檢測的致命弱點(diǎn)。
為了克服該問題,以下問題必須注意:
(1)您購買的PCR法支原體檢測試劑盒,其擴(kuò)增產(chǎn)物中必須含有內(nèi)參(Internal Contol)條帶作為對照【本試劑盒的586 bp條帶就是內(nèi)參條帶】。否則,如果沒有內(nèi)參作為對照,即使樣品擴(kuò)增后沒有支原體特異條帶,你也無法確定是因?yàn)闃悠反_實(shí)沒有支原體還是因?yàn)镻CR被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制導(dǎo)致的假陰性。
(2)如果出現(xiàn)PCR的擴(kuò)增被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制時(shí),請使用血液基因組DNA抽提試劑盒,抽提支原體DNA后再進(jìn)行PCR鑒定。
(3)同時(shí)使用本公司生物試劑的《一步法恒溫支原體檢測試劑盒》進(jìn)行檢測,經(jīng)嚴(yán)格測試,該試劑盒的擴(kuò)增不會被細(xì)胞的代謝產(chǎn)物抑制。
本試劑盒與Sigma公司的LookOut Mycoplasma PCR Detection Kit(貨號MP0035)的設(shè)計(jì)原理一樣,可以替代后者用于各類支原體的檢測。
根據(jù)支原體DNA的序列,本試劑盒可以識別所有100多種至今已發(fā)現(xiàn)的支原體,具有廣譜的識別能力。
如發(fā)現(xiàn)細(xì)胞被支原體污染,本公司提供細(xì)胞支原體清除和預(yù)防試劑。
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