簡介高遷移率族蛋白B1基本信息
高遷移率族蛋白于1973年在牛胸腺中被提取和鑒定，因其在聚丙烯酰胺凝膠電泳中的高遷移能力而得名。具體可參見Ferrari S, Finelli P, Rocchi M, Bianchi ME (July 1996). "The active gene that encodes human high mobility group 1 protein (HMG1) contains introns and maps to chromosome 13". Genomics 35 (2): 367–71. doi:10.1006/ge996.0369. PMID8661151.。根據(jù)分子質(zhì)量大小、序列相似性和DNA結(jié)構(gòu)特性，HMG可進(jìn)一步分為HMGA、HMGB、HMGN 3個家族。而HMGB家族又有3個成員，即HMGB1、HMGB2和HMGB3，三者在氨基酸序列上有80%的一致性。HMGB1是含量zui豐富的HMG蛋白，在典型的哺乳動物細(xì)胞內(nèi)約有106個分子，平均10～15個核小體即可含有1個HMGB1分子。HMGB1廣泛分布于淋巴組織、腦、肝、肺、心、脾、腎等組織中，HMGB1除在肝、腦組織中主要存在于胞漿外，在大多數(shù)組織中存在于胞核；而HMGB2/3分布較局限，HMGB2僅分布在淋巴組織中，HMGB3僅在胚胎中被發(fā)現(xiàn)，二者可能與胚胎發(fā)育有關(guān)。HMGB1先前也稱HMG1，在進(jìn)化過程中其氨基酸序列高度保守，嚙齒類動物與人的氨基酸序列同源性高達(dá)98%以上，小鼠與大鼠氨基酸序列同源性更是高達(dá)。
簡介高遷移率族蛋白B1結(jié)構(gòu)
（1）人類HMGB1基因位于13q12染色體上。HMGB1基因包括5個外顯子和4個內(nèi)含子[5]。HMGB1基因有十分強(qiáng)大的TATA盒啟動子。它的zui大活性是猴病毒40(SV 40)啟動子的18倍。這個啟動子還包括數(shù)個轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)，如激活蛋白1(AP1)。此外還包含一個沉默元件(silencer element)，因此，在一般環(huán)境條件下，HMGB1的表達(dá)量維持在基礎(chǔ)水平[6]。HMGB1基因敲除后幼鼠仍能存活，但存在廣泛的形態(tài)畸形，多于出生24 h內(nèi)死亡。
(2)人類HMGB1的初級氨基酸序列中含有219個氨基酸殘基，成熟HMGB1分子質(zhì)量為30 ku。HMGB1蛋白由3個*的結(jié)構(gòu)域組成。其中A-box位于N-末端，進(jìn)化高度保守；C-tail在羧基末端，包含30個重復(fù)的天冬氨酸和谷氨酸殘基，可參與調(diào)節(jié)HMGB1與DNA結(jié)合的親和力；B-box位于二者之間。A-box和B-box均由3個α螺旋組成，并帶有強(qiáng)烈的正電荷，構(gòu)成HMGB1的非特異性DNA結(jié)合區(qū)。HMGB1釋放至胞外后，B-box是引起炎癥反應(yīng)的功能結(jié)構(gòu)域，而A-box對B-box有一定的拮抗作用[7]。此外，人們把一個與A-box和B-box結(jié)構(gòu)域同源，約含85個氨基酸的重復(fù)區(qū)命名為DNA結(jié)合基元，為區(qū)別起見，將DNA結(jié)合基元的蛋白稱為HMG-box。HMG-box起源古老，其中包括序列特異性DNA結(jié)合蛋白和非特異性結(jié)合蛋白，系辨認(rèn)和結(jié)合變形DNA所必需的結(jié)構(gòu)[8]。HMGB1在不同的物種中高度保守，大鼠與小鼠的HMGB1蛋白序列*一致，與人類HMGB1蛋白的不同點(diǎn)只是C末端重復(fù)序列中有2個殘基被置換。
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